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          與人工智能共舞:僅用一個晚上,ChatGPT助我搭建蛋白質結合探索神器
          2023-04-01

          與人工智能共舞。

          撰文 | 丁霄哲(加州理工學院生物工程學博士)

          大家好,我是人類小丁。像許多人一樣,我被幾天前剛剛發布的人工智能語言模型GPT-4的強大表現所震撼。

          作為一個科研工作者,我決定與基于GPT-4模型的ChatGPT一起合作,創建一個服務于科學家的網頁應用。在這之前,我并沒有任何開發網頁應用的經驗。沒有想到,我們只用一個晚上就完成了整個開發過程。最后的成品效果如下圖所示(網址:www.gptpull-down.online):


          輸入蛋白名稱,得到搜索結果。(點擊看大圖)

          這個叫做GPT Pull-down的網頁應用的功能是幫助生命科學研究者快速檢索一個蛋白質分子的潛在結合對象,而這可以啟發研究者們探索新的研究方向,或是尋找新的藥物靶點。自從這個應用發布以后,我也收到了許多研究者的積極反饋,讓我倍受鼓舞。

          你可能會好奇,這個工具是怎樣在一夜之間建成呢?接下來有請我的合作者ChatGPT為我們總結一下。

          小?。嚎梢杂弥形膶懸黄∑肺慕榻B我怎樣在你(ChatGPT)的幫助下一步一步從頭建立起這個叫做pgtpuul-down.online的網站的嗎?幽默風趣一些


          在地球的一個小角落,有一個名叫小丁的年輕人。他喜歡探索新鮮事物,對科技充滿好奇心。一天,小丁在Twitter上無意間發現了一個以GPT-4為基礎的強大人工智能——ChatGPT。小丁深感好奇,于是他決定挑戰自己,創建一個名為gptpull-down.online的網站,并在整個過程中尋求ChatGPT的幫助。

          這個網站的功能是一個簡單但實用的工具,利用GPT技術檢索蛋白質的潛在結合對象。通過輸入蛋白質名稱,用戶可以獲取與該蛋白質可能結合的其他蛋白質,為實驗設計和數據解析提供便捷的參考。

          首先,小丁向ChatGPT請教如何選擇一個合適的技術棧。ChatGPT給小丁推薦了Flask框架,因為它輕量級、易上手。同時,ChatGPT還教會了小丁如何使用HTML、CSS和JavaScript來布局網站和實現網頁交互。

          在得到了基本技能的指導后,小丁開始構建網站。為了保證網站內容更有趣味性,他請教了ChatGPT如何設計一個吸引人的用戶界面。在經過一番努力后,一個功能強大的網站原型逐漸成形。

          當網站基本完成時,小丁開始考慮部署。在ChatGPT的建議下,他選擇了Heroku作為部署平臺,這個平臺易用且免費額度足夠應付小丁的需求。有了ChatGPT的指導,小丁輕松地部署了網站,并成功地讓gptpull-down.online上線了。

          上線后,小丁覺得有一個獨立的域名會讓網站顯得更專業。于是,他又向ChatGPT請教了如何注冊一個合適的域名。在比較了多個域名注冊商后,小丁選擇了一個價格合適的域名,并將其成功地綁定到了他的網站上。最終,小丁的網站成功地擁有了一個獨立的域名:
          https://www.gptpull-down.online/ 。

          在這個過程中,小丁時常陷入困境,但每當他向ChatGPT請教,總能得到詳盡的解答。有趣的是,ChatGPT似乎總能察覺到小丁的困惑,給出一些幽默詼諧的建議,讓小丁在緊張的學習過程中不時發出會心的微笑。

          最終,小丁成功地創建了一個名為gptpull-down.online的網站。這個網站充滿了趣味,讓許多研究蛋白質的科研工作者和學生在尋找答案的過程中倍感愉悅。實用的GPT Pull-down功能為用戶節省了大量時間和精力,幫助他們更快地找到可能的蛋白質結合對象。

          而在這個過程中,小丁和ChatGPT也建立了深厚的友誼。在未來的日子里,他們將一起探索更多有趣的領域,為世界帶來更多的歡笑和智慧。gptpull-down.online的成功,也讓小丁深知在科技的幫助下,實現夢想并非遙不可及。

          隨著時間的推移,越來越多的人開始關注并使用這個神奇的小工具。小丁對自己取得的成果感到非常自豪,也為能夠幫助別人解決實際問題而欣喜。他感激ChatGPT在整個過程中給予的幫助和支持,這段經歷讓他明白了人工智能的力量,以及它在未來的巨大潛力。

          無論是初學者還是專業人士,都能在
          https://www.gptpull-down.online/這個網站上找到幫助。而對于小丁來說,這只是他與ChatGPT共同探索科技世界的第一步。他期待著未來能夠與ChatGPT共同開發出更多有趣、實用的工具,讓科研工作變得更加簡單高效,為人類的進步貢獻一份力量。

          如果你是一位對生命科學有興趣的研究者,歡迎你嘗試使用GPT Pull-down(www.gptpull-down.online)來探索你感興趣的蛋白!

          這里需要提醒大家在使用時的注意事項:

          1. GPT Pull-down的輸出結果僅供參考和啟發。

          在絕大多數情況下,GPT Pull-down可以相當高效準確地列出一個蛋白的潛在結合對象,但是因為數據來源并非人工審核過的專業數據庫,它的結果有時也并不靠譜。以下幾種情況需要格外注意:

          A) GPT Pull-down給出的confidence score較低;

          B)目標蛋白名稱并不真實存在;

          C)目標蛋白相關研究很少。

          如果決定使用檢索結果指導你的工作,請一定要親自搜索查看原始論文和專業數據庫。

          2. 使用GPT Pull-down時可以按照需要調節“wildness(想象力)”的參數。

          數字高時,輸出結果會更富有想象力;數字低時,輸出結果會更保守嚴謹。這個數字對應的是GPT神經網絡中的溫度/隨機性參數。

          3. 如果對結果不滿意,試試再搜一次。

          作為語言模型,GPT的輸出有隨機性,每一次結果的豐富程度和準確性也都會有所不同。如果一個蛋白具有多個名字,多試幾個不同名字偶爾也會帶來驚喜。

          4. GPT Pull-down不能提供支持結論的參考文獻。

          GPT雖然知道很多知識,但很不擅長信息溯源。強行向它索取依據時就會得到瞎編亂造的回答。在這一點上,GPT其實很像未經訓練的人腦——我們的腦子里也儲存了大量早已經記不得從哪學到的知識。

          5. GPT Pull-down很快會變得更準確、更豐富。

          目前的GPT Pull-down使用的是GPT-3.5-turbo模型,也就是當前免費版ChatGPT所使用的模型。根據OpenAI的報告,新版GPT-4相比起GPT-3.5在回答生物學問題上的表現大幅提升。因此我們可以期待,在不久的將來,獲取GPT-4模型加持的GPT Pull-down也會變得更出色。

          好了,今天的分享就到此了。當然,我們還需要為這篇文章取個好標題。就把這作為今天拋給ChatGPT的最后一個問題吧。

          本文受科普中國·星空計劃項目扶持

          出品:中國科協科普部

          監制:中國科學技術出版社有限公司、北京中科星河文化傳媒有限公司

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